实验室赵金存课题组发现华南地区呼吸道冠状病毒NL63新亚型
2020-05-121626近日,实验室赵金存课题组与周荣课题组合作,首次在住院儿童呼吸道样品中发现呼吸道冠状病毒NL63的一个新亚型,且该亚型病毒在细胞入侵方面能力更强。该研究成果论文“Discovery of a subgenotype of human coronavirus NL63 associated with severe lower respiratory tract infection in China 2018”于2020年1月29日在线发表于国际知名期刊《Emerging Microbes & Infections》(EMI)上。
人呼吸道冠状病毒主要有7种,其中4种为常规冠状病毒,包括冠状病毒NL63、229E、HKU1和OC43,它们主要引起发烧、咳嗽等症状,常年在全球流行,在老年、儿童和免疫缺陷患者,也可引起重症。另外还有3种高致病性冠状病毒,包括:严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)和新型冠状病毒(2019-nCoV),可引起重症肺炎、甚至死亡。
图1. HCoV-NL63新亚型病毒时间相关进化
图2. HCoV-NL63新亚型病毒氨基酸多样性分析
研究相关背景
在儿童、成年人每年发烧感冒病原谱检测中,常规呼吸道冠状病毒一直是重要致病原之一。为监测常规冠状病毒的变异进化,赵金存课题组与周荣课题组合作,筛查广州地区冠状病毒感染病例,并通过高通量测序平台和假病毒入侵实验发现:在2018年住院儿童呼吸道样品中存在冠状病毒NL63一个新亚型,并通过高通量测序成功获得多株该亚型病毒全基因组,且研究发现该亚型病毒细胞入侵能力有很大提高。新冠状病毒NL63亚型的发现为病原的检测提供了新靶标、为临床诊断提供参考。新亚型呼吸道冠状病毒NL63的发现再次证明:自然界环境和人类生活圈中仍有很多未知病原或新亚型病原存在。2020年新型冠状病毒疫情的蔓延也再次提出警示:新病原的检测、发现是一个长期的工作,提早发现、提早防控是控制疫情的关键。
该项目获得国家重点研发计划、国家自然科学基金、广东省自然科学基金等项目支持。