RNA被认为是生命演化过程中出现最早的生物大分子，孕育地球生命的发生和发展。哺乳动物细胞基因组被广泛转录，其中1-2%的区域编码蛋白质，其余产生了大量的所谓基因组中的“暗物质”-非编码RNA。这些RNA在细胞命运的调控中行使着重要的功能如调控基因转录，信号转导，翻译等等。除此之外，新冠大流行极大地推进了mRNA治疗相关方面的发展，提供了人类对抗疾病/病原的一个新途径。本课题组围绕以上科学问题，重点关注以下研究方向：

1、利用化学生物学手段开发 RNA-蛋白互作研究的新方法、新技术，并应用于疾病如肺纤维化，慢性阻塞性肺病的研究

2、RNA-蛋白相互作用在细胞命运转变、肺病发生和肺发育等的功能和机制

3、利用 RNA 相关技术实现对肺部疾病的治疗和预防

1、国家重点研发计划 细胞周期和DNA甲基化在多能性建立、 维持和退出过程中的功能和机制研究 参与 2021年 2021YFA1100400 903万 子课题负责人 在研

2、国家自然科学基金-面上项目 RBM48调控胚胎干细胞‘2-细胞’状态的功能和机制 2022年 32170745 58万元 主持 在研

3、广东省杰出青年科学基金 利用“点击化学”探讨小鼠“胚胎干细胞”－“外胚层干细胞”转化过程中RNA结合蛋白的功能和机制 2018年 2018B030306042103 100万元 主持 结题

4、中国科学院青年创新促进会优秀会员项目 RNA结合蛋白研究 2020年 300万元 主持 结题

5、广东省生物岛实验室应急攻关专项 2019-nCoV靶向治疗策略探索 2019年 240万元 已结题

1、Bao X*,#, Guo X#, Yin M#, Tariq M, Lai Y, Kanwal S, Zhou J, Li N, Lv Y, Pulido-Quetglas C, Wang X, Ji L, Khan MJ, Zhu X, Luo Z, Shao C, Lim DH, Liu X, LiN, Wang W, He M, Liu YL, Ward C, Wang T, Zhang G, Wang D, Yang J, Chen Y, ZhangC, Jauch R, Yang YG, Wang Y, Qin B, Anko ML, Hutchins AP, Sun H, Wang H, Fu XD, Zhang B*, Esteban MA*. Capturing the interactome of newly transcribed RNA. Nat Methods. 2018 Mar;15(3):213-220. 28.467

2、Bao X*,#, Wu H#, Zhu X#, Guo X, Hutchins AP, Luo Z, Song H, Chen Y, Lai K, Yin M, Xu L, Zhou L, Chen J, Wang D, Qin B, Frampton J, Tse HF, Pei D, Wang H, Zhang B, Esteban MA*. The p53-induced lincRNA-p21 derails somatic cell reprogramming by sustaining H3K9me3 and CpG methylation at pluripotency gene promoters. Cell Res. 2015 Jan; 25(1): 80-92. 20.507

3、Liao B#, Bao X#, Liu L, Feng S, Zovoilis A, Liu W, Xue Y, Cai J, Guo X, Qin B, Zhang R, Wu J, Lai L, Teng M, Niu L, Zhang B, Esteban MA, Pei D. MicroRNA cluster 302-367 enhances somatic cell reprogramming by accelerating a mesenchymal-to-epithelial transition. J Biol Chem. 2011 May 13; 286(19): 17359-64.5.486中科院百篇高引论文

4、Ruiqi Zhao#; Xin Fang#; Zhibiao Mai#; Xi Chen; Jing Mo; Yingying Lin; Rui Xiao; Xichen Bao*;Xiaocheng Weng*; Xiang Zhou*; Transcriptome-wide identification of single-stranded RNA binding proteins, CHEMICAL SCIENCE, 2023, 14(15): 4038-4047. 8.40

5、Zheng M, Lin Y, Wang W, Zhao Y, Bao X*. Application of nucleoside or nucleotide analogues in RNA dynamics and RNA-binding protein analysis. Wiley Interdiscip Rev RNA. 2022 Feb 25:e1722. doi: 10.1002/wrna.1722. Epub ahead of print. PMID: 35218164. 7.30

6、Guo X#, Tariq M#, Lai Y#, Kanwal S#, Lv Y#, Wang X#, Li N, Jiang M, Meng J, Hu J, Yuan J, Luo Z, Ward C, Volpe G, Wang D, Yin M, Qin B, Zhang B*, Bao X*, Esteban MA*. Capture of the newly transcribed RNA interactome using click chemistry. Nat Protoc. 2021 Oct 25. 14.80

7、Lv Y#, Bu C#, Meng J, Ward C, Volpe G, Hu J, Jiang M, Guo L, Chen J, Esteban MA*, Bao X*, Cheng Z*. Global Profiling of the Lysine Crotonylome in Different Pluripotent States. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2021 Feb;19(1):80-93. 9.50

8、Shahzina Kanwal , Xiangpeng Guo , Carl Ward, Giacomo Volpe, Baoming Qin , Miguel A. Esteban *, Xichen Bao*Role of Long Non-coding RNAs in Reprogramming to Induced Pluripotency，Genomics Proteomics Bioinformatics，2020 18，16-25. 9.50

9、Hou L*, Wei Y, Lin Y, Wang X, Lai Y, Yin M, Chen Y, Guo X, Wu S, Zhu Y, Yuan J, Tariq M, Li N, Sun H, Wang H, Zhang X, Chen J, Bao X*, Jauch R*. Concurrent binding to DNA and RNA facilitates the pluripotency reprogramming activity of Sox2. Nucleic Acids Res. 2020 Feb 4.16.971

1、广东省科学技术奖励一等奖 2次

2、广州市科学技术奖励一等奖 1次